Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTA2P62736 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms