Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPEP62304 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNRPEP62304 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms