Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCD1P59942 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCCD1P59942 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms