Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRCA2P51587 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRCA2P51587 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms