Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRIP1P50238 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms