Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BRS3P32247 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRS3P32247 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRS3P32247 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRS3P32247 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRS3P32247 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRS3P32247 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRS3P32247 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRS3P32247 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRS3P32247 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BRS3P32247 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRS3P32247 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRS3P32247 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRS3P32247 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRS3P32247 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRS3P32247 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BRS3P32247 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BRS3P32247 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms