Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMLP26374 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMLP26374 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMLP26374 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMLP26374 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMLP26374 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMLP26374 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMLP26374 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMLP26374 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMLP26374 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMLP26374 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMLP26374 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMLP26374 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMLP26374 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMLP26374 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMLP26374 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMLP26374 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMLP26374 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMLP26374 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMLP26374 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMLP26374 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMLP26374 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMLP26374 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms