Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKCHP24723 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKCHP24723 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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