Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP100P23497 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP100P23497 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP100P23497 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP100P23497 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP100P23497 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP100P23497 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP100P23497 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP100P23497 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SP100P23497 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP100P23497 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP100P23497 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP100P23497 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP100P23497 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP100P23497 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP100P23497 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms