Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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NFKB1P19838 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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NFKB1P19838 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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NFKB1P19838 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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NFKB1P19838 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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NFKB1P19838 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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NFKB1P19838 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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NFKB1P19838 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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NFKB1P19838 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFKB1P19838 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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NFKB1P19838 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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NFKB1P19838 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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NFKB1P19838 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFKB1P19838 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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