Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sdc1P18828 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdc1P18828 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms