Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GM2AP17900 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GM2AP17900 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GM2AP17900 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GM2AP17900 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GM2AP17900 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GM2AP17900 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GM2AP17900 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GM2AP17900 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GM2AP17900 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GM2AP17900 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GM2AP17900 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GM2AP17900 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GM2AP17900 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GM2AP17900 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GM2AP17900 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GM2AP17900 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GM2AP17900 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GM2AP17900 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GM2AP17900 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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