Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCL5P13501 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCL5P13501 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCL5P13501 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCL5P13501 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL5P13501 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL5P13501 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL5P13501 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL5P13501 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL5P13501 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL5P13501 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL5P13501 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCL5P13501 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCL5P13501 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCL5P13501 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms