Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RLBP1P12271 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RLBP1P12271 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RLBP1P12271 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms