Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYP2C9P11712 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CYP2C9P11712 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms