Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALAP11233 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALAP11233 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RALAP11233 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALAP11233 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALAP11233 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALAP11233 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALAP11233 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALAP11233 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALAP11233 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALAP11233 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALAP11233 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALAP11233 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALAP11233 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RALAP11233 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RALAP11233 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RALAP11233 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RALAP11233 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RALAP11233 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALAP11233 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALAP11233 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RALAP11233 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALAP11233 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALAP11233 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALAP11233 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RALAP11233 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RALAP11233 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms