Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF12O95522 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF12O95522 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms