Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24BO95487 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24BO95487 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24BO95487 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms