Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRPF6O94906 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF6O94906 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms