Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SRGAP3O43295 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SRGAP3O43295 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms