Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHF1O43189 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHF1O43189 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF1O43189 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF1O43189 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF1O43189 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms