Protein–RNA interactions for Protein: O15397

IPO8, Importin-8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO8O15397 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IPO8O15397 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IPO8O15397 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IPO8O15397 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IPO8O15397 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IPO8O15397 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IPO8O15397 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IPO8O15397 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IPO8O15397 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IPO8O15397 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IPO8O15397 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IPO8O15397 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IPO8O15397 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IPO8O15397 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IPO8O15397 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IPO8O15397 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IPO8O15397 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IPO8O15397 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IPO8O15397 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IPO8O15397 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IPO8O15397 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IPO8O15397 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IPO8O15397 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IPO8O15397 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
IPO8O15397 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IPO8O15397 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IPO8O15397 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IPO8O15397 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IPO8O15397 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IPO8O15397 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IPO8O15397 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IPO8O15397 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IPO8O15397 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IPO8O15397 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IPO8O15397 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IPO8O15397 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IPO8O15397 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IPO8O15397 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IPO8O15397 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IPO8O15397 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IPO8O15397 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IPO8O15397 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IPO8O15397 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IPO8O15397 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
IPO8O15397 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms