Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SdcbpO08992 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SdcbpO08992 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms