Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GOLGA8SH3BPF8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA8SH3BPF8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA8SH3BPF8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms