Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc171E9Q1U1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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