Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SYNDIG1LA6NDD5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms