Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SPDYA-201ENST00000334056 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 MAN1C1-202ENST00000374329 2461 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CRISP2-203ENST00000618917 1492 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 MAB21L2-201ENST00000317605 2772 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 MEMO1-201ENST00000295065 4505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC007638.1-201ENST00000576751 1763 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC005072.1-201ENST00000606640 1779 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 BPIFA3-201ENST00000375452 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CRPP1-201ENST00000412857 625 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC008937.1-201ENST00000453721 914 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RN7SL766P-201ENST00000494719 309 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CR545473.1-201ENST00000511554 277 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 DIO3OS-209ENST00000556266 401 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC026826.2-201ENST00000560455 214 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TREML3P-202ENST00000564680 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 VTA1-203ENST00000452973 3177 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TGM5-206ENST00000611276 2510 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC112200.2-201ENST00000624673 1739 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC139100.1-201ENST00000588950 2035 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CDK20-204ENST00000375883 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RASGRP4-201ENST00000293062 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RASGRP4-203ENST00000433821 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RASGRP4-215ENST00000614135 2942 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RASGRP4-218ENST00000617966 2927 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SMAD3-202ENST00000439724 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TIMMDC1-208ENST00000494664 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 CARD8-221ENST00000521613 1903 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 LINC01804-203ENST00000492352 1871 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 AC011487.4-201ENST00000616855 525 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 LINC00969-297ENST00000627767 929 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 5_8S_rRNA.4-201ENST00000636054 151 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PTPRJQ12913 DFNB59-202ENST00000409117 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 PTCD2-211ENST00000536805 1911 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 IGSF1-202ENST00000370900 1786 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 AC234775.2-201ENST00000392722 1792 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PTPRJQ12913 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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