Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SORCS3Q9UPU3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SORCS3Q9UPU3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms