Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4E1Q9UPM8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4E1Q9UPM8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms