Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PADI4Q9UM07 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms