Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDC42EP3Q9UKI2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDC42EP3Q9UKI2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms