Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX25Q9UHL0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX25Q9UHL0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms