Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms