Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COPS7AQ9UBW8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COPS7AQ9UBW8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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