Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX3Q9UBR4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX3Q9UBR4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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