Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Irx4Q9QY61 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Irx4Q9QY61 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Irx4Q9QY61 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms