Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHL42Q9P2K6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms