Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DLL3Q9NYJ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DLL3Q9NYJ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms