Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SALL1Q9NSC2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SALL1Q9NSC2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms