Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP2Q9NS61 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms