Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF41Q9H4P4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF41Q9H4P4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF41Q9H4P4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF41Q9H4P4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF41Q9H4P4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF41Q9H4P4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF41Q9H4P4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms