Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMG9Q9H0W8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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