Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF541Q9H0D2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF541Q9H0D2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF541Q9H0D2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms