Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fundc1Q9DB70 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fundc1Q9DB70 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms