Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VN1R3Q9BXE9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms