Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRNP25Q9BV90 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP25Q9BV90 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms