Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnip2Q99JG7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnip2Q99JG7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.2 ms