Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGRRF1Q99675 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGRRF1Q99675 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGRRF1Q99675 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGRRF1Q99675 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGRRF1Q99675 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGRRF1Q99675 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGRRF1Q99675 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGRRF1Q99675 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms