Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBGCP5Q96RT8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBGCP5Q96RT8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms