Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EAF1Q96JC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EAF1Q96JC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms